基于蛋白质的生物制药是在工程细胞中通过复杂的过程生产的,可能包含各种各样的变异和翻译后修饰,必须监控或控制以确保产品质量。
利用稳健的克隆、表达、纯化和分析方法,在哺乳动物细胞中生产重组蛋白已经非常成熟。然而,意想不到的翻译后修饰(PTMs)或蛋白质产物变异可能会发生。这些可能包括不寻常的或意想不到的糖基化、氧化、脱酰胺化、糖基化、磷酸化、硫代化、S-硫代化、序列扩展等等。液相色谱-质谱联用或串联质谱联用(LC-MS 和 LC-MS/MS)已成为鉴定共价修饰(如 PTMs)或截断引起的质量差异的分析“工具箱”的首选。高分辨率和质量精度的质谱仪器,如电喷雾电离飞行时间(ESI-TOF)仪器,也有助于对这些变化进行有信心的识别。甚至更高的质量精度可以通过某些仪器如轨道阱或傅里叶变换-离子回旋共振(FT-ICR)获得。高分辨率仪器,加上 MS/MS 的功能,使 MS 成为蛋白质治疗表征中不可缺少的工具,在最近的生物制品许可申请中使用是比较频繁显见的。
最近研发发现通过质谱分析,在稳定转染的中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中发现了大量低水平(~ 1-5%)的杂质。这些分子包括抗体和 Fc 融合蛋白,其中 Fc 位于构建物的 C 端。经液相色谱-质谱(LC-MS)测定,杂质比预期质量大~1177Da。经过胰酶消化和 LC-MS/MS 分析,杂质以 Fc 序列延伸的形式定位到 Fc 的 C 端。利用不同的标准化碰撞能量(NCE)对扩展肽的两个电荷态进行目标高能量碰撞解离,导致几乎完全的片段离子覆盖。通过从头测序获得的氨基酸序列 SLSLSPEAEAASASELFQ 与转染 CHO 细胞所用的载体序列的一部分相匹配,特别是在蛋白质编码序列下游的选择盒的启动子区域。该修饰是一个意外的剪接事件的结果,由常用的 GGU 密码子的 C 端甘氨酸与一致的剪接供体相似引起。对甘氨酸的3个替代密码子进行了测试,结果表明,这些替代密码子完全消除了不需要的 C 端延伸,从而提高了产品质量。
选择性剪接在真核生物中是一种正常的、受调节的过程,能够从较少的基因中产生多种蛋白质产物。替代剪接和非预期剪接对生物疗法生产的影响,以及它是否合格作为一个关键的质量属性,确很少被讨论。
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