近几十年来，由于生物技术在识别和表征靶标和生产工业化数量的多肽和蛋白质方面的进步，基于蛋白质和多肽的生物治疗，包括抗体-药物偶联物（ADC）和蛋白质/多肽半衰期延长平台等非传统方式，已经成为快速增长的药物类别。除了作为生物治疗药物，蛋白质和多肽还可以作为诊断和指导疾病治疗的生物标志物。为了支持生物医学/药物研究，特别是新开发的支架可能为治疗疾病提供新的途径，有很大的发展需求生物分析分析可靠地量化来自不同发现和发展研究的生物样品中的这些大分子。
传统上，配体结合分析（LBA），如酶联免疫吸附分析（ELISA），一直是生物样品中蛋白质和多肽定量的主要平台。随着质谱（MS）和样品提取技术的进步，液相色谱-质谱（LC-MS）越来越多地被用作蛋白质和多肽生物分析的替代或补充技术。
LC-MS相对于LBA的主要优点是特异性高，方法开发时间短，能够同时分析多个分析物，特别是早期药物发现过程中，LBA的关键试剂不容易获得时。还需要使用LC-MS来研究肽和蛋白质的体内命运（分解代谢），以协助稳定性评估和化合物优化。
Aimsmass目前能够提供一种Middle Down分析策略. 这种方法不是将蛋白质作为小的替代肽或作为一个整体来分析，而是通过有限的酶消化和/或二硫键还原将分子分解成几个大的片段。该方法从单克隆抗体中生成三种类型的片段，即轻链（Lc）、重链（Fd）的N端半段和½Fc，每个片段约25 kDa，作为完整单克隆抗体的定量替代品。小尺寸的碎片提供了潜在的检测与提高灵敏度和分辨率。分析物的尺寸减小，Fc上糖基化引起的不均一性被消除，从而提高了灵敏度和检测分辨率。
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