蛋白定性通常是基于液质联用（LC-MS/MS）的鸟枪法蛋白鉴定，是基于自上而下（Bottom Up）的分析手段，样本类型通常是SDS-PAGE胶或者IP Pulldown 溶液；该方法适合于对蛋白进行全局定性分析，判断蛋白有无并提高了鉴定低丰度目标蛋白的可能性。蛋白定性分析适合于低预算，希望找到目标蛋白的大部分科研工作者。此种方法适合于初步研究蛋白质的实验室，低预算，周期短，结果可靠。通常可跑SDS-PAGE后切胶送样，也就是蛋白胶内质谱，或者采取直接取蛋白溶液质谱蛋白溶液质谱，两种方法各有不同，可以根据自己试验目的，采取不同手段，具体参考样本准备详情页可了解更多关于蛋白定性质谱的样本准备信息。
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