动物细胞基质通常用于生物制品的制造。因此，在生产过程中，来自细胞底物的微量/少量的 DNA，称为残留宿主细胞 DNA （rcDNA），可能会留在最终的制成品中。
病毒疫苗中与 rcDNA 相关的主要风险是传染性和致癌性；如果存在逆转录病毒原病毒、DNA 病毒的整合副本或外染色体基因组，rcDNA 可能会传播病毒感染；如果存在病毒或细胞底物（来自肿瘤或致瘤性）致癌基因，rcDNA 可能会带来致癌的潜在风险。
尽管 rcDNA 测定可以在整个生产过程的不同阶段使用适当的方法进行，但目前还没有一种通用的方法来定量测定动物来源的 rcDNA。膜杂交和阈值法传统上用于生物制药中宿主rcDNA的定量。杂交方法在一些药典文献中仍有描述。
聚合酶链反应（PCR）的技术是很流行的检测和定量 rcDNA 近年来，通常被认为是最实用和强大的常规方法 rcDNA 定量/序列特定物种，敏感，快速进行，适合高通量格式。此外，所需的设备和试剂可从多个供应商获得。目标基因组区域的选择对检测结果有影响；选择宿主基因组中多个拷贝中发现的目标DNA序列，将增加 rcDNA 被检测和准确定量的可能性。
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